監督：ジャスティン・リン | 脚本：サイモン・ペグ/ダグ・ジョン/ジーン・ロッデンベリー/ロベルト・ガストン・オルシ/ジョン・D・ペイン/パトリック・マッカイ
あらすじ：
企業号の船員たちは五年間にわたる探索の旅をはじめましたが、途中で異星に留まり、地元の種族に追い打ちされた話です。船長のコーク（クリス・パインが扮します）は、企業号を率いて宇宙探査の旅を続けました。彼はレナード・ボーンズ・マッコイ（カール・アーバンが扮します）に船長の身元についての心配を述べました。彼は親友のスポック（ザカリー・クイントが扮します）と心の中を打ち明ける前に、彼らは緊急救助の任務を受けました。謎の敵であるカール（イドリス・エルバが扮します）は企業号を攻撃し始め、生き残りした企業号のメンバーもある惑星に分散して生き延びようとしています。レナード・ボーンズ・マッコイ、スポック、コーク、チェーホフ（アントン・イェルチンが扮します）、ウフラ（ゾーイ・サルダナが扮します）、スールー（ジョン・チョーが扮します）などの船員は再び団結して、生きるために戦います。スコット（サイモン・ペグ）は、Jayla（ソフィア・ブテラが扮します）と出会った後、すべての船員を集めてその星から脱出する方法を見つけました。カールが宇宙艦隊を壊滅させる前に、彼を止めることに成功しなければいけません。
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